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DATE DE PUBLICATION : 28 FEVRIER 2024

Depuis le début de la pandémie de la COVID-19, plusieurs données montrent une augmentation de la prévalence des infections résistantes aux antibiotiques et une hausse des infections nosocomiales. Une étude récente pointe une incidence alarmante de candidoses multirésistantes chez les patients atteints de la COVID-19, avec des taux de morbidité et de mortalité élevés. Compte tenu de la prévalence croissante des infections résistantes, l'utilisation d'outils de surveillance comme le séquençage du génome entier est essentielle pour empêcher la propagation de ces infections.

Les facteurs de risque et le traitement de la candidose associés à la COVID-19

La candidose est une infection provoquée par Candida, un champignon. La candidose associée à la COVID-19 est définie comme « une infection secondaire ou une surinfection de candidose survenant après l'événement COVID-19. »

Dans un examen systématique analysant les isolats fongiques de 2018 à 2020 dans 48 hôpitaux du monde entier, il est indiqué que  « la prévalence des infections à C. auris a progressé pour atteindre 14 % chez les patients atteints de la COVID-19, en particulier chez ceux souffrant de diabète sucré (42,7 %), d'hypertension (32,9 %) et d'obésité (14,6%), ainsi que ceux chez qui a été posé un cathéter veineux central (76,8 %), ceux qui ont séjourné en service de soins intensifs (75,6%) et ceux qui ont utilisé des antibiotiques à large spectre (74,3 %). »

Des facteurs présumés ont été identifiés comme susceptibles de contribuer à l'augmentation des infections à C. auris chez les patients atteins de la COVID-19. L'affaiblissement du système immunitaire du patient, l'usage d'antiviraux ou d'immunosuppresseurs et les dommages directs causés par le virus SRAS-CoV-2 sont soupçonnés d'être à l'origine de cette progression. Des facteurs liés au milieu des soins de santé comme la pénurie d'équipements de protection individuelle (EPI) et une mauvaise hygiène des mains, qui ont accompagné l'apparition rapide et le rythme accéléré de la pandémie, peuvent également avoir joué un rôle.

Outre la hausse de la prévalence des infections à candidose, les études font également état d'une augmentation des souches multirésistantes. Les infections résistantes peuvent être plus difficiles, voire impossibles à traiter, en raison des possibilités limitées d'antibiothérapie efficace. Le traitement des infections fongiques comprend généralement l'usage d'antifongiques comme le fluconazole, le voriconazole ou l'amphotéricine B. Toutefois, comme le montre cette étude, seules les échinocandines sont capables de traiter les infections à C. auris multirésistantes.

 

Les outils de surveillance peuvent aider à lutter contre la candidose associée à la COVID-19

Les options thérapeutiques étant limitées, le dépistage précoce est essentiel : comme le soulignent les auteurs de l'étude, « on estime généralement qu'un dépistage précoce et un traitement adapté sont essentiels pour améliorer l'évolution des infections à C. auris à l'ère de la COVID-19. » Cependant, le diagnostic clinique des infections à Candida chez les patients atteints de la COVID-19 est difficile et dépend essentiellement de la vigilance des cliniciens à l'égard des symptômes d'infection. Compte tenu de l'enjeu, la prévention et la surveillance des infections à l'aide d'outils comme le séquençage du génome entier pourraient contribuer à « révéler l'épidémiologie des infections associées aux soins de santé et à mieux maîtriser et prévenir ces infections. »

Le séquençage du génome entier est un outil de pointe de surveillance des infections qui peut servir à comprendre la base génétique des mécanismes de résistance. Il aide à lutter contre la propagation de l'antibiorésistance en améliorant la surveillance et en fournissant aux chercheurs les informations nécessaires pour identifier le pathogène et suivre sa propagation et son évolution.

Le séquençage du génome entier est plus souvent utilisé dans les pays à revenus élevés en raison de son coût et de sa complexité. Toutefois, comme l'a montré la pandémie de la COVID-19, l'accessibilité mondiale aux outils de diagnostic et de surveillance joue un rôle essentiel dans la limitation de la maladie. 

Compte tenu de la forte prévalence des infections à candidose associée à la COVID 19 résistantes, ainsi que d'autres types d'infections associées aux soins de santé, il est essentiel d'avoir accès à des outils de diagnostic et de surveillance afin d'améliorer le suivi des patients. Une approche collective et globale, reposant sur des diagnostics rapides combinés à une surveillance mondiale des maladies, peut contribuer à freiner l'augmentation et la propagation de la candidose associée à la COVID-19 et à d'autres infections résistantes.

 

 

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