L'ionisation par désorption laser assistée par matrice (MALDI) utilise un laser pour absorber l'énergie d'une matrice et générer ainsi des ions par fragmentation des grosses molécules. Elle permet d'analyser des biopolymères tels que l'ADN, les protéines, les peptides, les hydrates de carbone et d'autres macromolécules organiques. Dans la spectrométrie de masse à temps de vol (TOF : Time-of-flight), un analyseur mesure le rapport masse/charge (m/z) des molécules chargées.